แต่ในปีนั้นประเทศไทยของเรา ได้ประสบกับปัญหา วิกฤตเศรษกิจอย่างรุนแรง แต่ด้วยความตั้งใจและมุ่งมั่น ทางคณะผู้ก่อตั้ง ได้ร่วมมือ ร่วมแรง ร่วมใจที่จะฟันฝ่าอุปสรรค นานัปการจนสามารถผ่านวิกฤตนี้มาได้ ซึ่งในที่สุดทุกอย่างก็ดำเนินไปด้วยความเรียบร้อยเสร็จสมบูรณ์และเริ่มเปิดให้บริการอย่างเป็นทางการในวันที่ 16 กันยายน พ.ศ. 2542 บนเนื้อที่ 5 ไร่ ริมถนนพหลโยธิน โดยได้รับพระกรุณา จาก สมเด็จพระเจ้าพี่นางเธอ เจ้าฟ้ากัลยาณิวัฒนา กรมหลวงนราธิวาสราชนครินทร์ เสด็จมาเป็นองค์ประธานในพิธีเปิด

ในช่วงแรก อาคารของโรงพยาบาลเป็นอาคารเดี่ยว 5 ชั้น ชื่ออาคารสมสราญ สามารถรองรับคนไข้ได้ จำนวน 100 เตียง อาคารนี้ได้รับการออกแบบทั้งภายนอกและภายใน โดยคำนึงถึงหลักการและผลวิจัยทางการแพทย์ รวมทั้งทางด้านจิตวิทยาที่เกี่ยวข้องกับผู้ป่วย และสถานพยาบาล เพื่อให้ทุกพื้นที่ภายในโรงพยาบาลได้อำนวยความสะดวก และเกิดประโยชน์สูงสุดกับผู้มาใช้บริการ ทางคณะผู้ก่อตั้งใส่ใจในรายละเอียดและเฝ้าดูแลตั้งแต่เสาต้นแรกจนเสร็จสมบูรณ์ บรรยากาศภายในโรงพยาบาล เราเน้นให้เปรียบเหมือนกับบ้านหลังใหญ่ เมื่อเข้ามาใช้บริการแล้ว รู้สึกอบอุ่น ผ่อนคลาย ด้วยความทุ่มเททั้งแรงใจแรงกาย ทำให้โรงพยาบาล บี.แคร์ เมดิคอลเซ็นเตอร์ ประสบความสำเร็จเป็นที่ยอมรับอย่างรวดเร็ว และขยายตัวอย่างต่อเนื่อง จำนวนผู้ป่วยที่เข้ามารับการรักษาและจำนวนบุคลากรทางการแพทย์ที่เชี่ยวชาญเพิ่มมากขึ้นอย่างรวดเร็ว จนในที่สุด อาคารปานปิติ อาคารหลังที่ 2 ก็ได้ถูกสร้างขึ้นและเสร็จสมบูรณ์ในปี พ.ศ. 2550 ซึ่งเป็นอาคาร 6 ชั้น ที่สามารถรองรับผู้ป่วยได้เพิ่มขึ้นอีก 50 เตียง

ปัจจุบันโรงพยาบาล บี.แคร์ เมดิคอลเซ็นเตอร์ มีเตียงรับผู้ป่วยใน 150 เตียง ห้องตรวจโรคต่างๆ สามารถให้บริการผู้ป่วยนอก ได้วันละ 2,000 คน มีศูนย์รักษาโรคและคลินิกเฉพาะทาง ให้บริการตลอด 24 ชั่วโมงแบบครบวงจร โรงพยาบาล บี.แคร์ เมดิคอลเซ็นเตอร์ มีเครื่องมือทางการแพทย์ที่ทันสมัย และมีประสิทธิภาพ พร้อมทั้งมีบุคลากรทางการแพทย์ที่เชี่ยวชาญทุกสาขา